Главная \ Новости ВРТ и статьи \ Ученые визуализировали судьбу каждой клетки эмбриона асцидии

Ученые визуализировали судьбу каждой клетки эмбриона асцидии

Затем ученые проследили судьбу каждой из клеток. Они предположили, что паттерн экспрессии материнской и дочерних клеток близок и сравнивали результаты секвенирования для каждого деления. В результате построили «генеалогическое древо» клеточных линий. Специализацию клетки на каждом этапе определяло повышение экспрессии определенного набора генов, который продолжал быть активным на всех последующих стадиях.

На следующем этапе исследователи совместили развитие клетки во времени с ее пространственным положением в зародыше. Необходимо было понять место каждой из клеток на 4D-реконструкции эмбриона. Для каждой стадии это пришлось делать отдельно: экспрессия некоторых генов отличалась вдоль передне-зданей и анимально-вегетативной осей зародыша, но определяющие оси гены были различными на этапах 16, 32 и 62 клеток.

В итоге авторы работы определили физическое положение всех клеток и создали 4D анимации, которые отображают экспрессию генов, морфологию и историю развития каждой из клеток эмбриона. Модель выложили в открытый доступ, и любой исследователь может воспользоваться ей.

Секвенирование РНК одиночных клеток и другие методы исследования активности генов эмбрионов стали главным прорывом 2018 года по версии журнала Science. Эти и другие технологии помогают ученым создавать различные визуализации зародышей. С помощью той же микроскопии плоскостного освещения сняли на видео развитие эмбриона мыши до стадии 64 клеток. Существуют и реконструкции эмбрионального развития человека на более поздних этапах, например, вот этот интерактивный атлас, созданный на основе 15 тысяч гистологических препаратов.

Оригинал статьи: https://nplus1.ru/news/2020/04/21/digital-embryo